基于分子標記柑橘遺傳多樣性研究.pdf

1、柑橘由于栽培歷史悠久、種屬間易雜交、天然突變頻繁以及長期的自然和人工選擇等因素，導致種類繁多，遺傳多樣性極其豐富，品種區(qū)分難，進化起源問題極其復雜。本研究利用SSR、InDel及來自lncRNA的分子標記對我國不同地區(qū)的45份野生、半野生及地方寬皮柑橘資源進行了遺傳多樣性分析，并利用SSR和InDel分子標記對58份柑橘大翼橙資源和26份來自不同國家與地區(qū)的椪柑資源、開展了遺傳多樣性研究，結果如下：
　　1.利用SSR和InDel

2、分子標記的對26份來自不同國家與地區(qū)的椪柑資源進行了分析。21對引物共獲得62個標記位點，產生了105條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到5條多態(tài)性擴增條帶。多態(tài)性標記位點的平均PIC值為0.32，平均期望雜合度為0.30。群體遺傳結構和主坐標軸分析均表明，椪柑資源內部遺傳多樣性水平低，遺傳變異較小。印度酸橘與椪柑遺傳關系較遠，Emperor、瀨戶見及早香等椪柑雜交后代，與椪柑存在明顯的遺傳差異，通過不同的分子標記組合可以有效鑒別區(qū)分椪柑材

3、料。
　　2.利用SSR和InDel分子標記引物對來自不同地區(qū)的45份野生、半野生及地方寬皮柑橘資源進行了遺傳多樣性分析。22對引物共獲得56個標記位點，產生了197條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到8.9條擴增條帶，多態(tài)性標記位點的平均PIC值為0.40，平均期望雜合度為0.29。群體遺傳結構、主坐標軸和聚類分析均表明，莽山野柑是一類原始獨特的柑橘種質；起源于南嶺山脈的野生寬皮柑橘，如道縣野橘、懸崖野橘、莽山橘、江永野橘、崇義野橘

4、等構成了一類獨特于其它寬皮柑橘的原始野生類群；古老栽培柑橘中的皺皮柑類型，包括旺蒼皺皮柑、皺皮柑、藏橘等構成了另一個原始古老類群；現(xiàn)代栽培柑橘城固冰糖橘中具有典型皺皮柑的基因滲入。寬皮柑橘中的一些育成品種及雜柑資源，具有較豐富的遺傳多樣性。本研究證實了起源于南嶺山脈一帶的野生寬皮柑橘在遺傳背景上較為接近，其多樣性也低于現(xiàn)代栽培寬皮柑橘，缺乏人為馴化和外源基因滲入，為南嶺山脈是我國寬皮柑橘的起源中心這一論斷提供了科學依據(jù)。由于長期的人為馴

5、化和外源基因的滲入，寬皮柑橘的演化伴隨著遺傳多樣性水平由低向高逐漸演變的過程。
　　3.利用SSR與InDel共21對引物對58份柑橘大翼橙資源進行了遺傳多樣性分析。共獲得57個標記位點，產生了131條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到6.2個多態(tài)性條帶，多態(tài)性標記位點的基因多樣性為0.14-1.11，期望雜合度為0.04-0.97，PIC值為0.13-1.04。群體遺傳結構分析、聚類分析和主坐標分析均表明元江野生宜昌橙是不同于現(xiàn)有宜

6、昌橙資源的新類型，在元江宜昌橙野生種群內存在較高的遺傳分化。研究結果表明元江野生宜昌橙是有別于其它地區(qū)宜昌橙資源的新類型，需加強對該資源的原位保護，在進行元江宜昌橙野生資源的收集時，以居群為單位加以收集保護，可獲得更高的遺傳多樣性。
　　4.基于LncRNA數(shù)據(jù)開發(fā)分子標記，通過利用野生與地方柑橘品種群體進行驗證，結果表明，基于LncRNA開發(fā)的分子標記的遺傳多樣性水平與SSR和InDel分子標記的水平相當，且整體結果與利用SSR