花生種質(zhì)資源基于InDel標(biāo)記的遺傳多樣性.pdf

1、種質(zhì)資源是作物遺傳改良的物質(zhì)基礎(chǔ)?；ㄉN質(zhì)資源的遺傳多樣性的研究是種質(zhì)資源收集、鑒定和利用的有效方法，對發(fā)掘優(yōu)良種質(zhì)資源、拓寬育成品種的遺傳基礎(chǔ)等具有重要意義。AFLP、SSR等分子標(biāo)記相繼被開發(fā)并應(yīng)用于花生遺傳多樣性研究中，但由于多態(tài)性較低、成本較高等原因，成為制約花生分子標(biāo)記輔助選擇研究的瓶頸，因此開發(fā)多態(tài)性高的分子標(biāo)記用于遺傳多樣性的研究意義重大。InDel標(biāo)記作為一種新型共顯性標(biāo)記，具有重復(fù)性好、特異性高及檢測方法簡捷的特點，在

2、近些年來得到了快速的發(fā)展。InDel遍布于整個基因組，其中一些位于決定基因功能的關(guān)鍵性區(qū)域。InDel標(biāo)記已應(yīng)用于多種作物的品種鑒定、多樣性分析、高密度遺傳圖譜構(gòu)建及目標(biāo)性狀精細(xì)定位等方面的研究?；贗nDel標(biāo)記的高多態(tài)性、檢測方便的特征，本文利用InDel標(biāo)記對54份地方花生種質(zhì)資源的遺傳多樣性進行了研究分析，首先明確InDel標(biāo)記在花生遺傳多樣性研究中有效性與可靠性，其次找到與InDel標(biāo)記相關(guān)的表型性狀或基因并加以探討。主要研究

3、結(jié)果如下:
　　1.54份地方花生品種資源和104份美國微核心種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀考察結(jié)果顯示，微核心種質(zhì)包含我國未報道的植物學(xué)類型秘魯型資源，植株高大，單株結(jié)果數(shù)較多，單株產(chǎn)量較高;我國地方品種植株多為直立型，美國微核心種質(zhì)多為匍匐型;兩者主莖高及側(cè)枝長變化范圍接近;微核心在單株果數(shù)與粒數(shù)上都占有較大優(yōu)勢，但單株果重與單株粒重與我國地方品種較相近;我國地方品種各類型資源的百仁重和出仁率均高于微核心資源;美國微核心種質(zhì)對褐斑病、網(wǎng)斑

4、病的抗性均較高于我國地方品種，其中多粒型和秘魯型在抗褐斑病上表現(xiàn)優(yōu)異，而普通型在抗網(wǎng)斑病上抗性更高。這些結(jié)果為花生種質(zhì)資源的育種應(yīng)用提供了依據(jù)。
　　2.利用48對InDel標(biāo)記對54份地方花生種質(zhì)資源進行分子標(biāo)記掃描，其中24對具有多態(tài)性，共擴增出126條清晰可見的條帶，其中51條為多態(tài)性條帶，多態(tài)性位點百分率為40.48％;各多態(tài)性引物的多態(tài)性比率主要集中于30％～60％，平均為39.17％。這些差異條帶可以揭示材料之間的遺傳

5、差異，表明InDel標(biāo)記的多態(tài)性較高。
　　3.24對InDel引物在54份資源品種間的PIC的變幅為0.0364(InDel-028)～0.9030(InDel-001)，Shannon's(Ⅰ)變幅為0.0922(InDel-028)～2.447（InDel-001），其中InDel-001，InDel-019，InDel-038，InDel-013，InDel-040和InDel-010最有效，其H'指數(shù)均在1.4以上，等位

6、變異數(shù)6個以上，有效變異數(shù)4.3個以上，表明有效等位變異數(shù)和H'值均能真實地反映其遺傳多樣性。
　　4.NJ系統(tǒng)發(fā)育樹、主坐標(biāo)分析圖及STRUCTURE三種方法的結(jié)果顯示，花生地方種質(zhì)資源可明顯區(qū)分為疏枝亞種和密枝亞種兩大類，其中疏枝亞種包括多粒型和珍珠豆型，密枝亞種包括龍生型和普通型，且三者結(jié)果基本保持一致并且與預(yù)期相符。
　　5.11個標(biāo)記與5個農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)，決定系數(shù)R2的范圍為5.3％～33.2％。性狀分別為莢果長、