融合蛋白質網(wǎng)絡和基因表達數(shù)據(jù)的關鍵蛋白質識別方法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蛋白質是細胞生命活動所必需的蛋白質，是生物體生存和繁殖不可或缺的一部分。蛋白質的識別不僅對于生命科學的研究具有重要意義，而且對于疾病診治和藥物設計也具有重要的應用價值。在后基因組時代，隨著高通量技術的發(fā)展，可獲得的蛋白質相互作用數(shù)據(jù)日益豐富，基于蛋白質相互作用網(wǎng)絡的蛋白質識別方法受到越來越多人的關注。
　　本研究主要內容包括：⑴深入分析蛋白質測度參數(shù)DC，BC，CC，SC，EC，IC，BN，DMNC，SoECC和LAC，并將這些測

2、度參數(shù)分別應用于酵母蛋白質網(wǎng)絡，實驗結果表明僅僅依靠蛋白質網(wǎng)絡的識別方法對網(wǎng)絡的依賴性較強，缺少對于網(wǎng)絡噪聲（例如假陽性相互作用）的容錯能力。⑵針對單純依靠節(jié)點中心性測度識別蛋白質對于網(wǎng)絡可靠性依賴性較大這一問題，本文利用邊聚集系數(shù)測度節(jié)點的共簇程度，利用皮爾遜相關系數(shù)測度蛋白質/基因共表達的程度，提出了一種融合蛋白質網(wǎng)絡拓撲特性和基因表達數(shù)據(jù)來識別蛋白質的中心性測度參數(shù)PeC。基于酵母蛋白質網(wǎng)絡的實驗結果表明，相較于其他蛋白質識別方法

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