祁連山青海云杉天然群體遺傳多樣性ISSR分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、青海云杉(Picea crassifolia kom.)是我國特有樹種,在西北地區(qū)分布廣闊。歷史上天然林遭受過強度破壞,有的遺傳資源已經(jīng)丟失,要對現(xiàn)有天然群體進(jìn)行科學(xué)保護(hù)和合理利用,必須首先弄清其種內(nèi)遺傳多樣性和遺傳分化,為種質(zhì)資源保存和該樹種的遺傳改良提供理論依據(jù)和基礎(chǔ)資料。 根據(jù)祁連山青海云杉天然群體的資源分布和實地調(diào)查結(jié)果,在祁連山分布區(qū)內(nèi)選取了10個天然群體,通過ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對青海云杉天然群體的遺傳多樣性進(jìn)行了研

2、究。 研究結(jié)果如下: 1.青海云杉ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立 以青海云杉基因組DNA為材料,對影響其PCR擴增結(jié)果的各個因素(Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、模板DNA、引物、退火溫度)進(jìn)行篩選和優(yōu)化,最終確定適應(yīng)于青海云杉ISSR-PCR反應(yīng)的最佳反應(yīng)體系。在20μL反應(yīng)體系中包含1μL10×buffer,1.5 mmol/L的Mg2+,0.2mmol/L的dNTPs,TaqDNA聚合酶1.0U,

3、模板DNA40ng,引物0.6μmol/l,。PCR擴增程序為94℃預(yù)變性4min,94℃變性45s,48-58℃退火(退火溫度隨引物而定)1min,72℃延伸2min,40個循環(huán),72℃延伸10min。 2.青海云杉天然群體遺傳多樣性分析 應(yīng)用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對10個群體共169個個體進(jìn)行了遺傳多樣性分析。從50條引物中篩選出10條引物。10條ISSR引物共擴增到120個位點,其中83個是多態(tài)性位點,總的多態(tài)性位點

4、百分率(PPL)為69.17%。Nei's基因多樣性指數(shù)(He)為0.2128,Shannom多態(tài)性信息指數(shù)(D為0.3219。10個不同群體的遺傳多樣性水平差異不大。群體多態(tài)性位點百分率在36.67%-59.17%之間,Nei's基因多樣性指數(shù)為0.1263-0.1863,Shannom多態(tài)性信息指數(shù)為0.1915-0.2823。10個群體間的遺傳分化系數(shù)Gst為0.2897,說明群體間存在一定程度的遺傳分化,群體間基因流Nm為0.6

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