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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:一、進(jìn)一步了解肝癌中長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)的改變及其臨床意義。
二、進(jìn)一步了解長(zhǎng)鏈非編碼RNA在肝癌發(fā)生發(fā)展中的作用。
方法:一、從前期所做的高轉(zhuǎn)移性肝癌和低轉(zhuǎn)移性肝癌長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜芯片中挑選一條在癌與癌旁有明顯差異以及在高轉(zhuǎn)移性肝癌和低轉(zhuǎn)移性肝癌之間有差異表達(dá)的lncRNA。
二、通過(guò)5'3'RACE實(shí)驗(yàn)得該長(zhǎng)鏈非編碼RNA的全長(zhǎng)序列。
三、從東方肝膽外科醫(yī)院國(guó)家肝臟
2、組織樣本庫(kù)挑選81例肝癌病人的癌組織及遠(yuǎn)端正常肝臟組織,利用實(shí)時(shí)定量PCR的方法檢測(cè)該長(zhǎng)鏈非編碼RNA在這些樣本中的表達(dá),并分析表達(dá)量與各臨床指標(biāo)的相關(guān)性。
四、運(yùn)用甲基化測(cè)序等方法研究DNA甲基化對(duì)其表達(dá)的影響。
五、包裝過(guò)表達(dá)該長(zhǎng)鏈非編碼RNA的慢病毒,以此為工具通過(guò)體內(nèi)體外的實(shí)驗(yàn)對(duì)其功能進(jìn)行研究。
結(jié)果:一、該條新的未被研究過(guò)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(我們稱之為SRHC,StrikinglyRe
3、duced in Hepatocellular Carcinomas)在肝癌中表達(dá)顯著下調(diào),在約80%的肝癌中表達(dá)低于對(duì)應(yīng)的癌旁組織,在20%的肝癌組織未能檢測(cè)到其表達(dá)。
二、SRHC在大部分肝癌細(xì)胞系中表達(dá)極低或缺失(如SMMU-7721、HCCLM3)。
三、SRHC有三種不同的剪切形式,剪切體1使其最主要的剪切形式。
四、在81例肝癌病人中分析其表達(dá)量與臨床病理特征的相關(guān)性顯示SRHC的表
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