魚(yú)類(lèi)自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗(yàn)證.pdf

1、分類(lèi)號(hào)j：UDC——IIIIIIIIIIIIIIIIIIII、Y3275109學(xué)號(hào)叢!!!!!密級(jí)——埸H大譬YANGZHOUUNIVERSlTY碩士學(xué)位論文(全日制學(xué)術(shù)學(xué)位)魚(yú)類(lèi)自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗(yàn)證鐘繼漢申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士論文提交日期：2Q12生壘旦論文答辯日期：2Q!Z生三旦2Z旦學(xué)位授予單位：塹劌盤(pán)鱟學(xué)位授予13期：2Q12生魚(yú)旦2Q旦2017年5月魚(yú)類(lèi)自主pogo轉(zhuǎn)座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗(yàn)證魚(yú)類(lèi)自主pogo轉(zhuǎn)

2、座子的挖掘、進(jìn)化及活性驗(yàn)證中文摘要Tcl轉(zhuǎn)座子超家族廣泛分布于細(xì)菌、真菌及昆蟲(chóng)等各種生物中，有些Tcl轉(zhuǎn)座子超家族成員已經(jīng)被開(kāi)發(fā)為重要的遺傳育種操作工具，如SB轉(zhuǎn)座子已經(jīng)作為基因治療和轉(zhuǎn)基因的介導(dǎo)載體得到廣泛應(yīng)用。pogo轉(zhuǎn)座子是Tel轉(zhuǎn)座子超家族的重要成員，但對(duì)其分布、進(jìn)化和活性研究報(bào)道很少。本研究通過(guò)硬骨魚(yú)轉(zhuǎn)座組注釋?zhuān)⒃诩棺祫?dòng)物中針對(duì)Tcl轉(zhuǎn)座子超家族的重要成員pogo轉(zhuǎn)座子進(jìn)行分布、進(jìn)化和活性研究，以挖掘活性pogo轉(zhuǎn)座子，研發(fā)

3、自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的遺傳操作工具，為動(dòng)物轉(zhuǎn)基因和基因治療等研究提供技術(shù)支撐。主要研究?jī)?nèi)容如下：(1)通過(guò)生物信息學(xué)手段對(duì)9種硬骨魚(yú)轉(zhuǎn)座組進(jìn)行注釋。結(jié)果表明9種硬骨魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)座組大4；FD構(gòu)成差異顯著，其轉(zhuǎn)座組含量從高到低分別為斑馬魚(yú)、矛尾魚(yú)、青鯔魚(yú)、花斑劍尾魚(yú)、大西洋鱈魚(yú)、三刺魚(yú)、金娃娃、羅非魚(yú)和紅鰭東方純，轉(zhuǎn)座子含量和基因組大小呈正相關(guān)。DNA轉(zhuǎn)座子在硬骨魚(yú)類(lèi)中具有多樣性高和含量差異大的特點(diǎn)(050％一3837％)，是硬骨魚(yú)類(lèi)轉(zhuǎn)座組差異的主要決

4、定因素，其中hAT和Tc／Mariner超家族是硬骨魚(yú)類(lèi)主要的DNA轉(zhuǎn)座子。RNA轉(zhuǎn)座子在硬骨魚(yú)類(lèi)中也具有多樣性高的特點(diǎn)，其中LINE轉(zhuǎn)座子占硬骨魚(yú)類(lèi)基因組053％566％，共檢測(cè)到12個(gè)(I、CRl、L1、L2、R1、R2、Jockey、RTE和Rex)超家族分布，其中L1、L2、RTE和Rex轉(zhuǎn)座子擴(kuò)增較為明顯，LTR轉(zhuǎn)座子除了在斑馬魚(yú)和三刺魚(yú)中含量達(dá)到558％和251％，在大多硬骨魚(yú)類(lèi)基因組中的含量低于2％，在硬骨魚(yú)類(lèi)中共檢測(cè)到6