挖掘癌相關蛋白的精細功能并重建癌相關功能子網.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目前，人們對癌基因(蛋白)的相關功能及生物學通路的認識還比較有限，限制了癌癥的研究進展。因此，出現(xiàn)了許多利用基因表達與蛋白質互作等關系來預測基因與蛋白質功能的算法。然而，目前的算法都將焦點放在功能完全未知的蛋白質上。事實上，很多已注釋的癌蛋白的功能知識還很粗泛，因此進一步探索這些癌蛋白的細致功能對探索癌癥的發(fā)病機制具有重要的意義。對于已知部分功能的癌蛋白，本文提出了一種結合Gene Ontology功能先驗知識和蛋白質互作，通過構建功能

2、特異的局部互作網絡來挖掘癌蛋白的細致功能的方法。在構建的功能特異的互作網絡中，以較高的精確率和覆蓋率將GO中已知部分功能的蛋白質預測到了更為精細的功能類中。作為應用，預測了口腔癌、肺癌、結腸癌等相關癌蛋白的細致功能。 雖然癌癥是一種高度異質的復雜疾病，其發(fā)生發(fā)展涉及到不同的癌基因，但最終癌蛋白都可能通過改變一些共同的重要功能類而影響癌的發(fā)展。在本工作中，進一步擴展先前構建的功能特異的局部互作網絡中的蛋白質相互作用數(shù)據，將新的蛋白

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