基于Z曲線理論的轉錄因子結合位點的識別研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、隨著人類基因組計劃的完成,生物信息學已經(jīng)進入了后基因組時代。對基因非編碼區(qū)的研究已經(jīng)成為研究的熱點問題之一,其中一個主要研究方向是對轉錄因子結合位點的研究。 本文將Z曲線理論引入到轉錄因子結合位點的研究中來,提出了基于Z曲線理論的坐標矩陣模型(ZCCM),ZCCM模型本質上是一條能夠表示轉錄因子結合位點特性的中心曲線的坐標矩陣,能夠較全面、較準確的描述轉錄因子結合位點的特征和保守性信息,提出了計算轉錄因子結合位點序列與中心曲線之

2、間的相似性距離向量,并以其為特征,進行BP神經(jīng)網(wǎng)絡訓練和分類,在大腸桿菌E.coli的轉錄因子結合位點的識別實驗中取得了較好的結果,并與MetInspector方法進行了比較,實驗表明,ZCCM模型具有良好的性能,能夠較準確表示轉錄因子結合位點的特征,對數(shù)據(jù)信賴性較小,自身較為完善,有較好的穩(wěn)定性和準確性。 本文提出了新的表示轉錄因子結合位點的模型ZCCM,給出構建模型的方法、算法步驟,并結合實驗證明了該模型的優(yōu)點和有效性,ZC

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