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文檔簡介
1、熱休克蛋白(HSPs)是一類在所有有機體中廣泛存在的一類熱應激蛋白質,按其分子量大小又可以分為6類,分別為HSP100、HSP90、HSP70,、HSP60、HSP40以及SmallHSP。熱休克蛋白的主要功能是當有機體暴露于高溫環(huán)境時,會發(fā)生熱休克應激反應,從而合成此類蛋白以保護有機體,可見其具有很高的研究價值。但是目前對熱休克蛋白的研究主要是集中在人類上,而且已確定的熱休克蛋白的種類和數(shù)目也很少,特別是在人以外的物種之中。熱休克蛋白
2、在進化過程中是否保守?是否還有許多新的熱休克蛋白有待發(fā)現(xiàn)?為了揭示這些問題,本文通過生物信息學方法將已知的人類熱休克蛋白按家族分類后分別對果蠅,柄海鞘,斑馬魚,非洲爪蛙,家雞,小鼠,大鼠和黑猩猩的全基因組序列進行比對,得到可能存在的HSP功能基因。并從以上9個物種選取HSP70家族中的已確定基因進行系統(tǒng)分析,以確定其進化上的保守性。
主要研究結果:
1.序列比對結果表明除了柄海鞘Small HSP家族外,其他
3、各物種的不同家族均存在大量潛在的新熱休克蛋白。
2.對人類已知的熱休克蛋白質的DNA序列進行比對,結果表明熱休克蛋白在進化上具有很高的保守性。
3.用MEGA中基于鄰接法構建的HSP70已知氨基酸序列鄰接系統(tǒng)發(fā)育樹表明,所有的物種并未明顯按照低等到高等的進化趨勢分簇,說明HSP70在進化中具有高度的保守性。較高的自展驗證值支持了該進化樹拓撲結構的準確性。
4.為了進一步驗證HSP的保守性,在使用
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