生物信息學(xué) 期末復(fù)習(xí)

1、■一、選擇題:1.以下哪一個是mRNA條目序列號：A.J01536■.NM_15392C.NP_52280D.AAB1345062.確定某個基因在哪些組織中表達的最直接獲取相關(guān)信息方式是：■.UnigeneB.EntrezC.LocusLinkD.PCR3.一個基因可能對應(yīng)兩個Unigene簇嗎？■可能B.不可能4.下面哪種數(shù)據(jù)庫源于mRNA信息：■dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGS5.下面哪個數(shù)據(jù)庫面向人類疾病構(gòu)建：A.ES

2、TB.PDB■.OMIMD.HTGS6.Refseq和GenBank有什么區(qū)別：A.Refseq包括了全世界各個實驗室和測序項目提交的DNA序列B.GenBank提供的是非冗余序列■.Refseq源于GenBank，提供非冗余序列信息D.GenBank源于Refseq7.如果你需要查詢文獻信息，下列哪個數(shù)據(jù)庫是你最佳選擇：A.OMIMB.Entrez■PubMedD.PROSITE8.比較從Entrez和ExPASy中提取有關(guān)蛋白質(zhì)序列

3、信息的方法，下列哪種說法正確：A.因為GenBank的數(shù)據(jù)比EMBL更多，Entrez給出的搜索結(jié)果將更多B.搜索結(jié)果很可能一樣，因為GenBank和EMBL的序列數(shù)據(jù)實際一樣■搜索結(jié)果應(yīng)該相當，但是ExPASy中的SwissProt記錄的輸出格式不同9.天冬酰胺、色氨酸和酪氨酸的單字母代碼分別對應(yīng)于：■NWYB.QWYC.FWYD.QNW10.直系同源定義為：■不同物種中具有共同祖先的同源序列B.具有較小的氨基酸一致性但是有較大的結(jié)構(gòu)

4、相似性的同源序列C.同一物種中由基因復(fù)制產(chǎn)生的同源序列D.同一物種中具有相似的并且通常是冗余的功能的同源序列11.下列那個氨基酸最不容易突變：A.丙氨酸B.谷氨酰胺C.甲硫氨酸■半胱氨酸12.PAM250矩陣定義的進化距離為兩同源序列在給定的時間有多少百分比的氨基酸發(fā)生改變：A.1%B.20%■.80%D.250%13.下列哪個句子最好的描述了兩個序列全局比對和局部比對的不同：A.全局比對通常用于比對DNA序列，而局部比對通常用于比對蛋

5、白質(zhì)序列B.全局比對允許間隙，而局部比對不允許C.全局比對尋找全局最大化，而局部比對尋找局部最大化■全局比對比對整體序列，而局部比對尋找最佳匹配子序列14.假設(shè)你有兩條遠源相關(guān)蛋白質(zhì)序列。為了比較它們，最好使用下列哪個BLOSUM和PAM矩陣：■BLOSUM45和PAM250B.BLOSUM45和PAM1C.BLOSUM80和PAM250D.BLOSUM10和PAM115.與PAM打分矩陣比較，BLOSUM打分矩陣的最大區(qū)別是：A.最好

6、用于比對相關(guān)性高的蛋白B.它是基于近相關(guān)蛋白的全局多序列比對■它是基于遠相關(guān)蛋白的局部多序列比對D.它結(jié)合了全局比對和局部比對32.下列具有最小基因組的原核生物可能是：A.嗜極生物B.病毒■胞內(nèi)細菌D.桿菌33.要證明某大腸桿菌中的某個基因是水平轉(zhuǎn)移而來，需要：A.分析該大腸桿菌中該基因的GC含量與其他基因是否有很大差異B.分析該大腸桿菌中該基因的密碼子使用與其他基因是否有很大差異C.系統(tǒng)發(fā)生分析該基因與其他物種中基因的同源關(guān)系■獲取以

7、上三個方面的信息34.C值矛盾是指：A.某些基因組中核苷酸C的含量少B.真核生物基因組大小同編碼蛋白質(zhì)的基因個數(shù)沒有相關(guān)性■真核生物基因組大小同屋中的復(fù)雜性相關(guān)性很小D.真核生物基因組大小同進化上的年齡相關(guān)性小35.成百上千個4~8bp的重復(fù)序列單元最可能出現(xiàn)在：A.散布性重復(fù)序列中B.假基因中■端粒中D.片段復(fù)制區(qū)域36.從頭預(yù)測真核基因的原因有：A.外顯子內(nèi)含子邊界難以確定B.內(nèi)含子長度可能只有幾個堿基對C.編碼區(qū)域的GC含量并不總

8、是與非編碼區(qū)相同■以上三個方面的原因37.人類基因組大小大約是多少Mb：A.130B.300■3000D.3000038.各種重復(fù)元件在人類基因組中大約占的百分比為：A.5%B.25%■50%D.95%39.蛋白質(zhì)編碼區(qū)域占人類基因組百分比是：■15%B.510%C.1020%D.204%40.人類基因組中GC含量高的區(qū)域：A.基因密度相對較低■基因密度相對較高C.基因密度多變D.基因所含密碼子相對較少41.人類復(fù)合孟德爾遺傳的基因疾病

9、約占疾病基因的：■1%B.10%C.50%D.60%42.單基因疾病趨向于：■在普通人群較少見，并且發(fā)生時間較早B.在普通人群較常見，并且發(fā)生時間較早C.在普通人群較少見，并且發(fā)生時間較晚D.在普通人群較常見，并且發(fā)生時間較晚名詞解釋1.生物信息學(xué)（bioinfmatics）：是一門結(jié)合生物技術(shù)和信息技術(shù)從而揭示生物學(xué)中新原理的科學(xué)。2.鳥槍法測序（shotgunmethod）一種測序方法，包括從基因組中獲得隨機的、已測序的克隆片段，并

10、且對初始基因的位置一無所知。3.BLAST：基本局部相似性比對搜索工具。在序列數(shù)據(jù)庫中快速查找與給定的序列具有最優(yōu)局部對準結(jié)果的序列的一種序列對算法。4.整體聯(lián)配（globalalignment）：對兩個核苷酸或蛋白質(zhì)序列的全長所進行的比對。5.FASTA：是第一個被廣泛使用的數(shù)據(jù)庫相似性搜索算法，這個程序通過掃描序列中“詞”的小配對，從而尋找最優(yōu)局部比對。6.算法（algithm）：在計算機程序中包含的一種固定過程。7.序列比對（al

11、ignment）：將兩個或多個序列排在一起，以達到最大一致性的過程（對于氨基酸序列是比較他們的保守性），這樣評估序列間的相似性和同源性。8.多序列比對（multiplesequencealignment）：三個或多個序列之間的比對，如果序列在同一列有相同結(jié)構(gòu)位置的殘基和（或）祖?zhèn)鞯臍埢?，則會在該位置插入空位。9.最佳聯(lián)配（optimalalignment）：兩個序列之間有最高打分值的排列。10.空位（gap）：在兩條序列比對過程中需要在