奶牛DGAT1基因SNPs分析及其與產(chǎn)奶性能關(guān)系的研究.pdf

1、本研究以三品系荷斯坦奶牛為對象，研究DGAT1基因單鏈核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）及其與奶牛產(chǎn)奶性狀之間的關(guān)系。根據(jù)GenBank中發(fā)表的黑白花奶牛DGAT1基因外顯子8、3’非翻譯區(qū)序列設(shè)計2對引物。采用PCR-SSCP技術(shù)分別檢測澳系、新系和中國荷斯坦奶牛在這兩個基因座中的SNPs。分析整個奶牛群體在多態(tài)性基因座上的遺傳結(jié)構(gòu)及其與產(chǎn)奶性狀之間的關(guān)系。結(jié)果表明：
　　

2、 1、在三個不同品系奶牛群體中，均發(fā)現(xiàn)了DGAT1基因外顯子8的三種基因型KK、KA、AA和3’非翻譯區(qū)的三種基因型MM、MN、NN；前者的基因型頻率分別為：新系0.37、0.43、0.20，澳系0.34、0.43、0.23，中國荷斯坦奶牛0.08、0.48、0.44。后者的基因型頻率分別為：新系0.1048、0.2476、0.6476，澳系0.0709、0.2482、0.6809，中國荷斯坦奶牛0.0467、0.2933、0.6600

3、；X2適合性檢驗表明三品系在3’非翻譯區(qū)座位上都未達(dá)到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)（P<0.01）；在外顯子8座位上都達(dá)到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)（P>0.05）。
　　 2、純合子測序結(jié)果表明：DGAT1基因外顯子8的KK基因型發(fā)生了GC→AA的錯義突變，導(dǎo)致了賴氨基酸突變?yōu)楸被?；DGAT1基因3’非翻譯區(qū)MM型在11992處和11993處的GT變成CA，NN型在11992處和11993處的GT變成

4、CA，11989處的T變?yōu)镚。
　　 3、群體遺傳特性分析結(jié)果表明：三品系DGAT1基因3’非翻譯區(qū)的基因雜合度分別為：新系0.4898、澳系0.4843、中國荷斯坦奶牛0.4696；有效等位基因數(shù)分別為：新系1.9600、澳系1.9391、中國荷斯坦奶牛1.8854； PIC值分別為：新系0.3699、澳系0.3670、中國荷斯坦奶牛0.3593。三品系DGAT1基因外顯子8的基因雜合度分別為：新系0.4853、澳系0.494

5、3、中匡I荷斯坦奶牛0.4352；有效等位基因數(shù)分別為：新系1.9429、澳系1.9775、中國荷斯坦奶牛1.7705； PIC值分別為：新系0.3675、澳系0.3722、中國荷斯坦奶牛0.3405。兩位點的基因雜合度值都不高，變異程度都不大，僅為中等水平；有效等位基因數(shù)都比較接近試驗檢測等位基因數(shù)2，等位基因在試驗群體中的分布比較均勻；兩座位在三品種奶牛中的多態(tài)信息含量PIC值相差不大，都處于0.25-0.5之間，達(dá)到中度多態(tài)。

6、r>　　 4、關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明：3’非翻譯區(qū)基因型與澳系荷斯坦奶牛產(chǎn)奶量和平均乳蛋白率呈顯著相關(guān)（P<0.05），MM型具有較高的產(chǎn)奶量，但乳蛋白率最低；該位點與新系荷斯坦奶牛產(chǎn)奶量顯著相關(guān)（P<0.05），MM型具有較高的產(chǎn)奶量。
　　 外顯子8的多態(tài)性與中國荷斯坦奶牛的乳脂率顯著相關(guān)（P<0.05），KK型的平均乳脂率比KA型高0.16，比AA型高0.27；該位點與澳系荷斯坦奶牛平均乳脂率和平均乳蛋白率呈顯著相關(guān)（P<0.