碭山酥梨果實PPO酶學特性、PPO克隆及生物信息學分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、碭山酥梨(Pyrus bretschneideri cv.)是我國栽培面積最大和對外出口的主要梨品種。近幾年,由于自然環(huán)境、品種退化、田間管理粗放等原因,梨果實石細胞含量增多,導致果實肉質變粗,口感多渣,嚴重影響了碭山酥梨果實的食用品質和經(jīng)濟價值。果實中石細胞是一種厚壁組織細胞,由次生壁在初生壁上沉積而形成,與木質素的合成、轉運及沉積密切相關。因此,對碭山酥梨果實中,石細胞發(fā)育、木質素合成及影響因素的研究就具有重要的意義。木質素合成重要

2、酶多酚氧化酶(PPO)可以通過木質素單體聚合等多種途徑影響木質素的合成。
   本實驗以碭山酥梨果實為材料,研究了木質素合成重要酶PPO變化規(guī)律,并探討PPO酶學特性,明確梨果實生長發(fā)育過程中,PPO活性與木質素、石細胞含量之間的關系。同時,克隆PPOcDNA,并進行生物信息學分析和結構預測,為從生理生化和分子生物學水平了解石細胞發(fā)育機理,調節(jié)石細胞含量奠定基礎。主要研究結果如下:
   1、碭山酥梨果實發(fā)育過程中,PP

3、O活性在花后27天和47天出現(xiàn)高峰,早于木質素含量高峰(花后47天、61天)和石細胞含量高峰(花后51天)。PPO活性變化與石細胞、木質素含量變化趨勢基本相同,均表現(xiàn)為先升高后下降的趨勢。作為PPO的一類酶,漆酶在果實發(fā)育發(fā)育初期含量最高,之后迅速下降,花后39天短暫回升后又迅速降低并維持較低水平。相關性分析表明,PPO活性變化與石細胞、木質素含量極顯著相關,但未發(fā)現(xiàn)漆酶活性與石細胞、木質素含量間有顯著的相關性。
   2、碭山

4、酥梨果實PPO的最適溫度為40℃左右,且高溫對PPO活性抑制作用比低溫更明顯;不同pH條件下,PPO活性變化表現(xiàn)為雙峰曲線,高峰期分別出現(xiàn)在pH7.0和pH5.0,且pH7.0條件下PPO活性為513.86U·g-1,顯著高于pH5.0條件下PPO活性229.43U·g-1。以鄰苯二酚為底物,梨果實PPO反應最適底物濃度是0.16mol·L-1;酶促褐變反應動力學符合米氏方程,動力學參數(shù)Vmax為54.5455U·g-1,Km為0.13

5、64mol·L-1。
   3、蔗糖、山梨醇、EDTA、檸檬酸、抗壞血酸對PPO活性均有一定的抑制作用,同濃度情況下抑制效果為:抗壞血酸>檸檬酸>EDTA>山梨醇>蔗糖。當抑制劑濃度為0.02 mol·L-1時,檸檬酸、抗壞血酸對PPO抑制作用最大,PPO相對活力分別為11.22%和5.24%,濃度高于0.5mol·L-1時,無未檢測到PPO活性。當抑制劑濃度從0.02mol·L-1提高到0.5mol·L-1時,EDTA對PPO

6、抑制作用最明顯,PPO殘留活性下降了71.45%。低濃度的蔗糖和山梨醇對PPO活性抑制作用不大,當濃度達到1.0mol·L-1時,PPO殘留活性分別為41.60%和31.20%。
   4、利用RTPCR技術克隆得到碭山酥梨果實PPOcDNA保守片段558bp,該序列已登錄GenBank,登陸號為HQ329065。利用RACE反應得到3’片段和5’片段,分別為1326bp和689bp,拼接得到PPOcDNA全長為1992bp,開

7、放讀碼框ORF含有1782個堿基,編碼583個氨基酸,Genbank登錄號為JF809859。
   5、對PPO編碼的氨基酸組成、結構和功能進行生物信息學分析和預測。利用ProtParam tool軟件推測氨基酸理論分子量為65.78KD,理論等電點為8.4,偏堿性。
   利用ScanProsite在線工具分析氨基酸序列含有兩個結構功能域,與PPO兩個保守的銅離子結合區(qū)域吻合,具有酪氨酸酶家族的特征。利用DNAman

8、軟件分析和同源性比對,氨基酸序列與同屬薔薇科植物 PPO同源性較高,其中與砂梨PPO相同氨基酸最多,達到99%。利用SignalP3.0 Server未發(fā)現(xiàn)可能的信號肽切割位點,利用在線ChloroP工具預測碭山酥梨PPO編碼氨基酸含有一條長度47bp的葉綠體轉運肽(CTP),與PredictProtein在線工具預測PPO亞細胞定位于葉綠體的結論一致。
   利用PredictProtein和SWISSMODEL在線工具預測P

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