玉米氣生根早期發(fā)育相關microRNA及其靶基因的鑒定.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、玉米(Zea mays L.)是世界上普遍種植的重要的谷類作物。它特有的氣生根可為玉米提供強大的抗倒伏能力;是玉米生長發(fā)育后期營養(yǎng)和水分吸收的主要器官;對于保證洪澇及干旱條件下玉米正常的產(chǎn)量有重要意義。MicroRNAs(miRNAs)是一類非編碼、內(nèi)源性的單鏈小分子量RNA,它們在植物的生長發(fā)育及脅迫響應過程中發(fā)揮著重要的作用。然而,關于玉米氣生根起始及早期發(fā)育的miRNAs未見報道。
   為了鑒定在玉米氣生根早期發(fā)育過程中

2、發(fā)揮作用的miRNA,我們利用Solexa高通量測序技術對玉米生長發(fā)育V4階段獲得了未形成氣生根的莖節(jié)(N),V6階段獲得含有剛突出氣生根的莖節(jié)(NR),和經(jīng)過IAA處理后的含有剛突出氣生根的莖節(jié)(NRI)三個組織的樣本進行測序得到了N,NR和NRI三個小分子RNA庫。通過與數(shù)據(jù)庫比對,分別從650,793(N),957,303(NR)和1,082,948(NRI)種小RNA序列中得到了511,617和462種匹配上已知miRNA前體的

3、小分子RNA序列。進一步的分析確定了137個保守miRNA(分屬于26個家族)以及159個新發(fā)現(xiàn)的非保守miRNA。其中,通過差異性分析分別得到了19個保守的和25非保守的氣生根相關的miRNAs,并通過qRT-PCR技術確認了其中14個保守的和16個非保守的miRNA,以及15個受miRNA調(diào)控的靶基因。另外,我們還發(fā)現(xiàn)除了氮、磷、碳,生長素也在氣生根發(fā)育過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用。
   本研究第一次分析了可能的氣生根起始和早期發(fā)育

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