基于遺傳標(biāo)記的烏骨山羊群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究.pdf

1、本研究利用14個(gè)SNP作為遺傳標(biāo)記，通過(guò)PCR-SSCP和PCR-RFLP實(shí)驗(yàn)技術(shù)基因分型，基于基因頻率利用軟件分析，從分子水平研究烏骨山羊群體遺傳結(jié)構(gòu)及烏骨山羊與酉州烏羊，麻城黑山羊、南江黃羊和波爾山羊之間的親緣關(guān)系，旨在為烏骨山羊選育工作提供參考。
　　 研究結(jié)果如下:
　　 1.14個(gè)SNP位點(diǎn)在烏骨山羊群體中觀察雜合度(Ho)平均為0.3463;期望雜合度(He)平均為0.3449;有效等位基因數(shù)(Ne)平均為1

2、.5830;群體多態(tài)信息含量（PIC平均為0.2754;Shannon指數(shù)平均為0.5125。
　　 2.在研究群體中相同的14個(gè)SNP標(biāo)記，烏骨山羊的平均有效等位基因、雜合度，多態(tài)信息含量和Shannon指數(shù)(1.5830、0.3463、0.2754、0.5125)均比與酉州烏羊(1.4634、0.3211、0.2305、0.4336)，麻城黑山羊(1.4137、0.3027、0.2110、0.4015)，南江黃羊(1.389

3、3、0.2262、0.2085、0.3968)，波爾山羊(1.4253、0.2459、0.2052、0.3903)高。
　　 3.烏骨山羊和其它四個(gè)山羊群體間的F檢驗(yàn)結(jié)果Fst和Fit分別為0.1468和-0.0245表明14.68％的遺傳變異是由不同的山羊群體間引起的，85.32％遺傳變異是由各群體內(nèi)引起的，2.45％的遺傳變異來(lái)自遠(yuǎn)交。
　　 4.Nei標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離聚類(lèi)分析，烏骨山羊和波爾山羊之間遺傳距離最遠(yuǎn)(Ds=

4、0.1942)，兩者的遺傳一致性系數(shù)最?。↖=0.8235）;烏骨山羊和麻城黑山羊遺傳距離最近(Ds=0.0720)，對(duì)應(yīng)的遺傳一致度系數(shù)最大(I=0.9305);此外，烏骨山羊等四個(gè)地方品種聚為一類(lèi)，波爾山羊單獨(dú)聚為一類(lèi)。
　　 5.本研究通過(guò)逐漸突變模型下的群體期望雜合度和基因每個(gè)世代的平均突變率估算烏骨山羊群體的規(guī)模大約為1.6萬(wàn)頭，有效群體含量約900頭，從數(shù)量上看烏骨山羊處于安全狀態(tài)。實(shí)際中，這些群體被分散在廣大地區(qū)，