皮蠹科DNA條碼分類技術研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、皮蠹科(Dermestidae)隸屬鞘翅目(Coleoptera)皮蠹總科(Dermestoidea),是一類重要的儲藏物害蟲,食性雜、繁殖力強,危害嚴重。皮蠹科廣泛分布于世界各地,目前全世界已知1000多種,我國約有100余種。種類準確識別鑒定是害蟲防治的基礎,皮蠹科分類以成蟲形態(tài)研究為主,幼蟲形態(tài)相似較難區(qū)別,由于形態(tài)研究對鑒定人員的分類知識和經(jīng)驗要求較高,實際工作中種類鑒定困難較大。近年來,快速發(fā)展的分子生物學技術為昆蟲種類的快速

2、鑒定提供了新的方法,但皮蠹科昆蟲的分子生物學研究仍處于初步階段,且目前的分子研究多集中于斑皮蠹屬(Trogoderma),也未有針對皮蠹科內(nèi)相關屬之間系統(tǒng)的分子進化研究。
  本文為首次利用DNA條形碼技術對皮蠹科倉儲害蟲進行分類研究。從DNA提取方法、PCR體系擴增進行試驗探索,構建皮蠹科分子系統(tǒng)發(fā)育關系,初步建立起皮蠹科基因條形碼數(shù)據(jù)庫,以期利用DNA條形碼技術實現(xiàn)對皮蠹科害蟲的快速分類鑒定。研究內(nèi)容及結(jié)果包括:
  1

3、.研究皮蠹科形態(tài)分類,分析重要種類的鑒定特征,攝取各種的背、腹、側(cè)面高清圖輔助鑒定。
  2.優(yōu)化DNA提取方法,探索了不同預處理方法對DNA提取效果的影響。經(jīng)過預處理后,一定程度上減少了基因組DNA的斷鏈,DNA更易擴增長片段,且不同位點擴增效果也較好,其中以9%NaCl溶液3h預處理后的昆蟲標本,利用磁珠法所提DNA的質(zhì)量及PCR擴增效果最佳。
  3.建立適宜的PCR擴增體系。反應體系中加入牛血清蛋白并增加 Mg2+濃

4、度,能提高PCR擴增效率及條帶質(zhì)量。設計的4對外圍巢式引物以A5/A6擴增效果最優(yōu),最佳退火溫度為49℃?;谛蛄蟹治鼋⒌?對巢式PCR組合,均能適用于較低濃度DNA擴增。
  4.COⅠ基因(細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ基因)序列分析。所獲皮蠹科COⅠ基因擴增序列為前端357bp及后端609bp片段,分別進行拼接校正、比對,利用MEGA分析了各序列保守位點、變異位點、簡約信息位點、自裔位點、各數(shù)據(jù)組堿基組成、堿基頻率、氨基酸組成、密

5、碼子使用情況,計算各物種間的遺傳距離及標準差,轉(zhuǎn)換與顛換比例。并對序列數(shù)據(jù)組系統(tǒng)發(fā)育信號進行檢測,證實序列非隨機數(shù)據(jù),可為下一步構建系統(tǒng)發(fā)育樹提供依據(jù)保證。
  5.系統(tǒng)發(fā)育研究。采用最大簡約法(MP)、最大似然法(ML)兩種建樹方法,對皮蠹科COⅠ前、后兩端序列組及其翻譯的氨基酸進行分析,構建系統(tǒng)發(fā)育樹。皮蠹科COⅠ基因后端序列片段所包含遺傳信息更豐富,構建的系統(tǒng)發(fā)育樹較少發(fā)生偏離,同形態(tài)分類的一致性高于前端片段,更適于作為皮蠹

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