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文檔簡介
1、急性脊髓損傷主要導致軸突變性、神經(jīng)元壞死、膠質瘢痕生成等,從而造成肢體麻痹、截癱。急性脊髓損傷后,脊髓內發(fā)生的病理變化及涉及的分子機理非常復雜,多數(shù)不為人們熟知。我們需要用新的方法來研究其中錯綜復雜的病理反應。蛋白質組學為我們提供了一個從蛋白質入手的研究途徑。
在眾多蛋白質中,難溶蛋白如膜蛋白、細胞器蛋白在很多病理過程中起著十分重要的作用,如細胞的相互作用與識別、離子的轉運、信號的轉導。此外,膜蛋白還是很多藥物的作用靶點。脊髓
2、組織中的難溶蛋白在脊髓損傷后可能也起著關鍵的作用,它們可以為我們提供更多的理論信息,具有重要的研究意義。然而,脊髓組織中蛋白質與蛋白質、蛋白質與脂質的相互作用使這些蛋白質的分離和溶解難度加大。為此,我們采用分步提取法來制備蛋白樣品,期望能夠最大程度地去除可溶蛋白,富集難溶蛋白。另外,對所采用的裂解液成分和濃度進行了調整,以提高難溶蛋白的溶解效率。
目的:建立正常和損傷脊髓難溶蛋白的2-DE圖,分析難溶蛋白的溶解效率及其差異表達
3、。
方法:采用大鼠脊髓橫斷模型,利用蛋白質組學的技術和理論針對脊髓組織難溶蛋白進行研究。使用分步提取法和改良的裂解液提取脊髓難溶蛋白,以雙向電泳技術分離蛋白質,凝膠染色、圖象分析后選取蛋白點,通過質譜技術獲取肽質量指紋譜,在蛋白質數(shù)據(jù)庫中查詢蛋白質。隨機選擇5個蛋白進行MALDI-TOF/TOF分析,以驗證MALDI-TOF-MS的結果。對部分差異蛋白采用RT-PCR和Westernblot的方法在mRNA水平和蛋白水平分別進
4、行了驗證。最后,通過專業(yè)軟件和數(shù)據(jù)庫從分子功能、生物過程和亞細胞定位三方面對所鑒定的蛋白進行分析。
結果:(1)成功建立重復性良好的脊髓組織難溶蛋白雙向電泳圖,2-DE考染膠顯示了約600個點;(2)經(jīng)圖像分析得到62個差異表達蛋白;(3)經(jīng)MALDI-TOF-MS分析和蛋白質數(shù)據(jù)庫查詢,成功鑒定出44個蛋白;(4)被鑒定蛋白的MALDI-TOF/TOF分析結果與MALDI-TOF-MS鑒定結果一致;(5)被鑒定蛋白的RT-P
5、CR結果和Westernblot結果與2-DE的結果一致;(6)所鑒定的蛋白中有70%為細胞器蛋白,32%為膜蛋白。其中,細胞器蛋白主要定位在線粒體和細胞核上,而膜蛋白主要是質膜、線粒體膜和其他膜蛋白;(7)所鑒定出的蛋白質按其功能可以分為兩大類:與其它分子結合的蛋白(61%)和可以催化其他反應的酶(68%);(8)根據(jù)蛋白參與的生物學過程,可分為五類:第一類參與應激反應;第二類參與發(fā)育過程;第三類參與代謝反應;第四類為其他類,這些蛋白
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