我國(guó)優(yōu)良茶樹(shù)品種遺傳多樣性分析及指紋圖譜構(gòu)建.pdf

1、茶樹(shù)是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)作物之一。近年來(lái)，已育成許多具有優(yōu)異性狀的茶樹(shù)品種。一方面，這些品種大多采用系統(tǒng)選種和雜交育種的方法選育而成，骨干親本類似，親緣關(guān)系比較接近，使品種的遺傳背景較窄。如果能從分子水平上揭示這些品種之間的親緣關(guān)系和遺傳結(jié)構(gòu)，將為雜交育種時(shí)親本的選擇提供一定的科學(xué)指導(dǎo)。另一方面，隨著，新培育出的優(yōu)良品種越來(lái)越多，對(duì)茶樹(shù)品種的鑒別提出了更高的要求。SSR（Simple sequence repeat，簡(jiǎn)單重復(fù)序列）分子指紋圖

2、譜鑒定技術(shù)具有簡(jiǎn)便、迅速不受環(huán)境條件影響等優(yōu)點(diǎn)，非常適合品種鑒定。本研究以254個(gè)優(yōu)良茶樹(shù)品種為材料，從前期構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜上選出185個(gè)SSR標(biāo)記，分析了我國(guó)茶樹(shù)品種的遺傳多樣性水平，并通過(guò)篩選出的核心引物，構(gòu)建了較全面的茶樹(shù)品種分子指紋圖譜。主要研究結(jié)果如下：
　　1.從185個(gè)SSR標(biāo)記中初步篩選出了128個(gè)擴(kuò)增條帶清晰、穩(wěn)定的SSR標(biāo)記。不同連鎖群上的SSR標(biāo)記檢測(cè)到的平均等位基因數(shù)、基因型個(gè)數(shù)、多態(tài)性息含量均有較大差異

3、。根據(jù)引物擴(kuò)增條帶易統(tǒng)計(jì)程度，PIC（Polymorphism information content，多態(tài)性息含量）和基因型個(gè)數(shù)，篩選了2套均勻分布于15連鎖群上的30對(duì)核心引物。理論上任意兩個(gè)品種可能混淆的概率為6.0×10-13。同時(shí)，通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)誤的變化，250個(gè)茶樹(shù)品種遺傳多樣性研究至少需要30對(duì)SSR引物。
　　2.利用128個(gè)SSR標(biāo)記分析了我國(guó)茶樹(shù)優(yōu)良品種的遺傳多樣性水平，在254個(gè)茶樹(shù)品種中共檢測(cè)到629個(gè)等位變異，

4、平均觀測(cè)雜合度HO為0.43，期望雜合度HE為0.54。Shannon信息指數(shù)（I）平均為1.03。PIC平均為0.5，基因多樣性指數(shù)平均為0.54。從地理區(qū)域來(lái)看，云南、廣東、重慶的品種基因多樣性水平較高，達(dá)到0.5以上；臺(tái)灣的品種遺傳多樣性水平最低，只有0.29。從不同時(shí)期分析，2000s育成品種的基因多樣性水平最高，達(dá)到0.54，其次是1990s，2010s，1980s最低。比較不同年代間平均遺傳距離的變化，發(fā)現(xiàn)1980s品種遺傳

5、距離為0.30，1990s上升到0.32，此后呈下降的趨勢(shì)?；谶z傳距離的N-J(Neighbor-joining)聚類將茶樹(shù)品種分為3個(gè)大類群，基于Structure數(shù)學(xué)模型的算法則將所有材料分為5個(gè)亞群。
　　3.應(yīng)用毛細(xì)管電泳（Capillary electrophoresis，CE）熒光標(biāo)記檢測(cè)分析手段與聚丙烯酰胺凝膠電泳（Polyacrylamide gel electrophoresis, PAGE）銀染檢測(cè)技術(shù)，選用