肺動脈閉鎖遺傳學初步研究.pdf

1、第一部分肺動脈閉鎖染色體核型分析
　　【目的】對肺動脈閉鎖患兒進行核型檢測,分析染色體異常與肺動脈閉鎖的關系。
　　【方法】35例肺動脈閉鎖患兒行G顯帶常染色體檢測。
　　【結果】發(fā)現(xiàn)1例合并有21三體綜合征,余染色體核型正常。
　　【結論】21三體綜合征可合并有肺動脈閉鎖,肺動脈閉鎖患兒染色體核型異常并不多見,提示應用常規(guī)染色體核型分析無法對這種嚴重復雜的先心病進行篩查。
　　第二部分肺動脈閉鎖TBX1微

2、缺失研究
　　【目的】對肺動脈閉鎖患兒進行TBX1微缺失檢測,探討肺動脈閉鎖與TBX1的關系。
　　【方法】選用荷蘭Kreatech公司PoseidonFISHDNA的KBI-40104MDDiGeorgeT-box1(22q11)/22q13(SHANK3),應用染色體原位熒光雜交技術(FISH)對染色體核型正常的34例肺動脈閉鎖患兒進行TBX1微缺失檢測。
　　【結果】發(fā)現(xiàn)3例TBX1微缺失陽性患兒,陽性率為8.8

3、2％。
　　【結論】TBX1是22q11.2微缺失的核心基因,22q11.2微缺失是肺動脈閉鎖的主要致病原因之一,TBX1可能是肺動脈閉鎖易感基因。
　　第三部分全外顯子測序初步篩選右室流出道梗阻易感基因
　　【目的】對一個右室流出道梗阻家系中2名成員進行全外顯子測序,進行數(shù)據(jù)分析,初步篩選右室流出道梗阻易感基因。
　　【方法】收集一個右室流出道梗阻家系中2名成員的靜脈血,采用lifetechnology全外顯子

4、捕獲試劑盒進行捕獲,用Lifetechnologysolid5500xl高通量測序儀進行高通量測序,測序結果與公共遺傳突變數(shù)據(jù)庫(db132SNP)及華中科技大學人類基因組中心正常人外顯子數(shù)據(jù)庫進行比對,過濾已報道的常見變異,再將單核苷酸非同義突變進行整合,初步篩選出候選基因。
　　【結果】結果顯示過濾后落在外顯子區(qū)域的單核苷酸變異(SNP)數(shù)目外婆為42727個,孫子為38207個;過濾后落在外顯子區(qū)域未報道的單核苷酸變異數(shù)目外

5、婆為4582個,孫子為4249個;通過ACCESS數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),有121個新發(fā)現(xiàn)單核苷酸變異同時存在于祖孫兩人的基因組中。同時使用華中科技大學人類基因組中心已有正常人外顯子對照數(shù)據(jù)庫進行篩選,46個變異沒有在對照數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)。將46個變異輸入到使用ANNOVAR軟件預測可能有害的突變位點,將候選基因范圍縮小到19個。
　　【結論】WNK1、KRTAP1-1、UBR2、EPS15、CKAP2、PIGB、DENND4A、HYDIN、C