陸地棉HB紅花近等基因系差異表達基因分析.pdf

1、HB紅花性狀來源于野生二倍體比克氏棉，陸地棉HB紅花基因被初步定位于7號染色體上。在本研究中,利用 SSR分子標記技術對HB紅花基因進行精細定位，基因芯片和蛋白質(zhì)組學技術也被應用于評估陸地棉HB紅花近等基因系的相關功能。
　　1、利用SSR分子標記技術，對HB紅花基因進行精細定位。根據(jù)近等基因系與輪回親本基因表達模式的差異，最終得到了5對差異引物，分別為A07-0646、A07-0592、A07-0594、CH07-44、CH07

2、-53，并構建了一個全長81.8cM的連鎖群，成功將HB紅花基因定位于A07-0592與A07-0594之間，與它們的遺傳距離分別是7.9cM和37.6cM。對比目前已有的陸地棉基因組測序信息，A07-0592和A07-0594之間物理距離為33Kb，包含21個基因，其中大于400bp的基因有4個，分別為MT-A70家族蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶、谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶、類谷氨酰胺轉(zhuǎn)酰胺酶類家族蛋白、八氫番茄紅素合成酶，為下一步克隆重要性狀相關基因并進行功

3、能分析與驗證奠定基礎，為陸地棉種質(zhì)創(chuàng)新和遺傳改良提供依據(jù)。
　　2、利用棉花全基因組cDNA芯片進行表達差異分析，獲得陸地棉HB紅花近等基因系與輪回親本間明顯差異表達基因80個（表達差異10倍以上），其中上調(diào)基因56個、下調(diào)基因24個，主要是與代謝和次生代謝調(diào)節(jié)相關基因、生物合成、細胞凋亡、信號傳導等有關聯(lián)的cDNAs及某些未知確切功能的基因。利用實時定量PCR技術，對通過基因芯片篩選出的4個明顯差異表達基因進行分析，分析結(jié)果進一

4、步明確了相關基因的表達調(diào)控規(guī)律，探討紅花性狀形成的因素。
　　3、應用差異蛋白組學方法，對陸地棉HB118與其輪回親本118之間不同器官、不同生育時期的差異表達蛋白進行了研究，檢測出表達豐度上在2倍以上的差異蛋白157個，其中花期葉片差異蛋白57個、絮期葉片差異蛋白56個、花差異蛋白44個，依據(jù)功能分為以下幾類：
　　（1）與碳水化合物代謝相關蛋白；
　　（2）光合作用相關蛋白；
　　（3）細胞骨架結(jié)構相關蛋白；