急性病毒性壞死病毒兩種功能基因的克隆、表達及功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、急性病毒性壞死病毒(acute viral necrosis virus, AVNV)是20世紀末導致我國北方沿海櫛孔扇貝大規(guī)模死亡的的重要致病病原。隨著AVNV的全基因組序列的測定完成,確定該病毒全基因組序列一共包含123個可能的開放型閱讀框(open reading frames, ORF),其中的44個開放型閱讀框具有一定的結構和功能。本論文通過基因克隆、原核表達、真核表達以及體外功能分析等技術研究其中兩種功能基因的功能,這對了解

2、AVNV的侵染機制和致病機理,從而為AVNV的防控提供有效理論依據(jù)。
  研究內容和結果如下:
  第一部分:通過基因克隆技術得到了AVNV ORF86編碼的桿狀病毒凋亡抑制蛋白基因(IAP-86),將IAP-86基因與pET32a(+)質粒連接構建得到重組質粒pET32a-IAP86,之后將重組質粒轉化到 E.coil BL21(DE3)中,使用終濃度0.1%的異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)進行蛋白誘導表達,SD

3、S-PAGE檢測顯示表達蛋白分子量約為40ku,經(jīng)Western-blotting和質譜分析證明該蛋白即為IAP-86融合蛋白,Co2+柱純化后得到了純化的的IAP-86融合蛋白。
  第二部分:對原核表達得到的IAP-86蛋白進行功能性分析,首先將重組的IAP-86蛋白用FITC標記,熒光顯微鏡下觀察,發(fā)現(xiàn)重組的IAP-86蛋白最終能夠與櫛孔扇貝血淋巴細胞的細胞核和細胞質結合,提示重組的IAP-86蛋白能夠進入到細胞內發(fā)揮作用。

4、使用細胞凋亡檢測試劑盒針對 IAP-86的抗凋亡作用進行分析,實驗結果證實重組的IAP-86蛋白能夠在一定程度上抑制櫛孔扇貝血淋巴細胞凋亡,凋亡抑制率在7%左右。
  第三部分:為深入探討魁蚶中檢測到的急性病毒性壞死病毒(acute viral necrosis virus, AVNV)魁蚶株的致病機理以及進一步研究IAP-86蛋白的功能,本實驗從感染AVNV的瀕死魁蚶外套膜中提取總RNA,反轉錄獲得cDNA。根據(jù)NCBI公布的A

5、VNV全基因組序列中ORF86序列設計兩對反向套式引物,通過cDNA末端快速擴增(RACE)技術獲得ORF865’端和3’端的非編碼區(qū),拼接獲得全長cDNA序列。Blast序列比對顯示,該基因與牡蠣皰疹病毒的相似性為100%,與櫛孔扇貝AVNV的相似性為99%,并存在重疊基因。生物信息學分析預測該蛋白不含有信號肽,不存在跨膜區(qū),最大疏水指數(shù)為1.800,最小疏水指數(shù)為-3.456。存在8個潛在的磷酸化位點(包括5個絲氨酸、1個蘇氨酸和2

6、個酪氨酸),存在1個潛在的O-糖基化位點,不存在潛在的N-糖基化位點;其抗原表位主要集中在8-11、14-16、28-39、75-76、88-95、97-100和147-158位氨基酸。
  第四部分:在使用原核表達技術對AVNV解旋酶進行表達未獲得成功的前提下,嘗試使用酵母表達系統(tǒng)對AVNV解旋酶進行真核表達,本部分通過基因克隆技術獲得了表達 AVNV解旋酶的開放閱讀框-ORF66,并將該基因連接到 pPIC9K表達載體上,構建

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