東方巴貝斯蟲頂質體基因組的測序分析及RON2在入侵中作用的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、東方巴貝斯蟲(Babesia orientalis)是牛的巴貝斯蟲病中比較特殊的一個血液原蟲蟲種,其僅感染水牛的紅細胞,由鐮形扇頭蜱經卵傳播。在我國長江以南多省份均有流行,患病動物常出現黃疸、高熱、貧血和血紅蛋白尿等癥狀,嚴重時甚至死亡,對我國的水牛養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經濟損失?,F階段對于東方巴貝斯蟲的基因組信息所知有限,入侵相關機制的研究也鮮有報道。
  基于此,本研究一方面克隆并注釋了東方巴貝斯蟲的頂質體基因組DNA序列,并對其總

2、體的結構特征進行了詳細的比對分析;另一方面,釣取了東方巴貝斯蟲棒狀體頸部蛋白2(RON2)基因信息,對RON2與AMA1的相互作用進行了初步研究。
  (1)B.orientalis頂質體基因組的測序分析
  對于頂質體基因組,根據基因組測序的高通量測序序列和cDNA文庫釣取的部分頂質體DNA序列,結合NCBI公布的頂復門血液原蟲頂質體DNA序列,選擇其保守區(qū)設計引物,克隆東方巴貝斯蟲頂質體DNA全長。測序結果用軟件進行拼接

3、,Artemis做注釋。結果表明,東方巴貝斯蟲頂質體基因組全長33200bp的環(huán)狀分子,AT含量在78.9%,包含1個核糖體大亞基(LSU)、1個核糖體小亞基(SSU),38個編碼蛋白的開放讀碼框以及24個轉運RNA(tRNA)。其中38個ORF包括4個DNA依賴的RNA合成酶小亞基(rpoB、rpoC1、rpoC2a、rpoC2b)、17個核糖體蛋白、1個翻譯延長因子(tufA)、2個Clp分子伴侶基因以及14個大小功能未知的假定蛋白

4、。進一步對所獲得的東方巴貝斯蟲頂質體基因組DNA與NCBI上有報道的相關頂復門寄生蟲作了詳細的比對分析,綜合的結果表明東方巴貝斯蟲頂質體基因組從基因組大小,基因種類,基因結構,基因排列順序,基因進化分析等一系列特征上都與牛巴貝斯蟲的頂質體最為接近。
  (2)棒狀體頸部蛋白RON2和AMA1基因的相互作用
  根據NCBI上公布的頂復門寄生蟲的RON2序列及部分假定蛋白序列和東方巴貝斯蟲基因組測序獲得的部分序列,設計引物克隆

5、東方巴貝斯蟲棒狀體頸部蛋白2(RON2)基因,獲得的測序結果全長為4035bp,本研究選取了RON2與AMA1有相互作用的功能域進行截短表達,分別設計特異性引物克隆BoRON2-2、BoRON2-5,構建GST標簽原核表達質粒pGEX-KG-RON2-2、pGEX-KG-RON2-5,高效表達。用純化后的RON2-2、RON2-5重組蛋白進行Far-western實驗,以及和AMA1蛋白的粘附ELISA實驗。結果表明,重組表達的RON2

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