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文檔簡(jiǎn)介
1、1、山羊中FSHβ基因遺傳標(biāo)記的強(qiáng)近代正選擇
促卵泡激素(FSH)是糖蛋白類激素,由腦下垂體前葉腺的促性腺細(xì)胞分泌。它調(diào)控性腺的發(fā)育及功能,并且對(duì)哺乳動(dòng)物的生殖功能十分重要?;蜻x擇模式的檢測(cè)的是了解多位點(diǎn)遺傳最重要的部分之一。這項(xiàng)研究使用的是基于FST技術(shù)的方法,在中國(guó)四個(gè)山羊品種的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)上進(jìn)行離群位點(diǎn)檢測(cè)。使用SNPs的離群位點(diǎn)檢測(cè)方法表明FSHβ受到自然選擇。另外10個(gè)物種的核苷酸序列也被用來(lái)檢測(cè)FS
2、Hβ基因的選擇作用,結(jié)果表明,該基因之前受到純化選擇,但目前正受到正選擇作用。山羊和其它物種的FSHβ基因的核苷酸序列分析顯示其編碼序列相似(綿羊:55%,馬:55%,牛:54%,兔:49%,人48%)。在這項(xiàng)研究中確認(rèn)的離群基因位點(diǎn)可有助于闡明,由于本地的氣候變化和頻繁的群體間交流引起的適應(yīng)性變異揭示了它們適應(yīng)新環(huán)境的能力??偠灾?,曾經(jīng)受到純化選擇的FSHβ基因目前正受到顯著的正選擇。
2、FSHR基因多態(tài)性與選擇信號(hào)的鑒
3、定及其對(duì)湖羊產(chǎn)羔數(shù)的影響
本文研究了湖羊群體中FSHR基因的遺傳變異,并探究其在湖羊群體中受選擇情況。本研究利用基因測(cè)序技術(shù)查找綿羊FSHR基因中的SNP位點(diǎn),利用基于FST的差異去探測(cè)綿羊FSHR基因受選擇信號(hào),結(jié)果表明第九外顯子上的C198T的FST值高于期望值,其可能受到人工選擇。為了研究FSHR基因物種間的進(jìn)化情況,利用數(shù)據(jù)庫(kù)中17個(gè)物種的序列,用最大似然模型檢測(cè)選擇信號(hào),結(jié)果顯示FSHR基因在物種間沒(méi)有檢測(cè)到正選擇信
4、號(hào),但發(fā)現(xiàn)了19S,329L,349Pand369 R受正選擇位點(diǎn)。對(duì)綿羊FSHR基因的蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)C198T位于與GnRH通路互作的蛋白保守區(qū)域,故可能改變FSHR基因的功能。通過(guò)測(cè)序共鑒定了15個(gè)SNP,其中12個(gè)位于內(nèi)含子區(qū)域,三個(gè)位于外顯子區(qū)域。2個(gè)內(nèi)含子SNP(G247T,A249G)及外顯子9上的一個(gè)SNP(C198T)與湖羊第二胎產(chǎn)羔數(shù)相關(guān),基因型頻率分別是GT(0.18)、GG(0.72)、TT(0.1),AG(0.
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