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文檔簡介
1、目的:制備HLA寡核苷酸分型芯片,并應用基因芯片篩查糖尿病腎病遺傳易感性內(nèi)容HLA分型在骨髓干細胞庫的建立、疾病易感性機理研究、組織器官移植等方面具有重大應用價值。由于 HLA 基因結構的高度多態(tài)性,對 HLA 抗原分型存在很大困難。目前對于HLA-Ⅰ、Ⅱ類抗原的分型,臨床上常常采用血清學方法,但由于該方法存在著廣泛的交叉反應和難以找到理想的單抗,常常出現(xiàn)技術上的困難和分型判斷誤差.PCR-SSP方法也有采用,國內(nèi)外的分型試劑盒大都采用
2、這種方法,但是因需要通過大量的電泳來確定分型結果,其臨床大量樣品應用也受到了限制。自20世紀90年代開始,基因芯片技術在高通量生物檢測領域得到迅速發(fā)展,日臻成熟。作為斑點雜交技術的延伸,基因芯片技術以其快速,高通量,大信息量檢測等特點,在HLA分型方面有很大優(yōu)勢,自基因水平對HLA-Ⅰ、Ⅱ工類抗原分型無論在準確性及方便性上都具有重要意義。設計了 213 種寡合苷酸探針,制備了基因芯片,建立了 HLA 寡核苷酸分型芯片這一檢測平臺,并應用
3、該分型芯片進行糖尿病。腎病的遺傳易感性研究。 方法:在本實驗中用三甲氧基硅烷建立了優(yōu)化環(huán)氧片基的制備方法。并依據(jù)第十三屆國際組織相容性工作會議報告及相關文獻,同時考慮遺傳的連鎖不平衡,及強脊炎,幼年型糖尿病等與 HLA 密切相關的遺傳病等因素,選擇了中國北方漢族人群基因頻率較高的等位基因,根據(jù)HLA-A,HLA-B,HLA-DR,HLA-DQB,HLA-DQA不同基因亞型的獨特序列,完成了探針的設計與篩選,最后設計了213條探針
4、,可完成中分辨度分型。在這一平臺的基礎上,進行一些應用基因芯片篩查糖尿病腎病遺傳易感性的相關研究工作。 結果:所有樣本的HLA-Ⅰ、Ⅱ類抗原基因分型均獲成功??煞直娉?98個Ⅰ類抗原基因型,511個Ⅱ類抗原基因型,可撿出Ⅰ類抗原基因位點57個,Ⅱ類抗原基因位點30個。并證實了B41、DR4等基因與糖尿病腎病的相關關系。 結論:這些探針完全可以完成中分辨率的組織配型,較臨床現(xiàn)在常用的進口試劑盒有更方便,更省時,更精確而且可
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