雞MC1R基因的SNPs分析與染色體定位.pdf

1、黑素皮質素受體1(melanocortin 1-receptor,MClR)基因是控制動物黑色素合成的重要基因.該研究以MClR基因作為控制雞黑色素合成的候選基因,以中國農(nóng)業(yè)大學的研究黑色素性狀的資源家系雞(由體內有廣泛黑色素沉積的絲羽烏骨雞和無黑色素沉積的明星肉雞為親本雜交產(chǎn)生)親本代和F<,2>代群體為材料,采用單鏈構象多態(tài)(Single-strand Conformation Polymorphism,SSCP)、限制性內切酶片段

2、長度多態(tài)(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)以及DNA測序的方法,對雞MClR的整個編碼區(qū)與5'與3'非編碼區(qū)進行了單核昔酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的檢測,將檢測到的SNPs與雞黑色素性狀的關系進行了分析,以探討將MClR基因作為控制雞黑色素沉積的候選基因的可能性.該研究首先利用PCR-SSCP與PCR-RFLP的方法在資源家

3、系群體雞MClR基因的編碼區(qū)與5'與3'非編碼區(qū)檢測到4個單核苷酸多態(tài)位點,并對該單核苷酸多態(tài)性進行了分析,結果顯示,雞MClR基因編碼區(qū)3個單核苷酸多態(tài)位點分別是由第867核苷酸位置處G→A轉換,第1292位核苷酸位置處的C→T顛換與第1377核苷酸位置處的C→G顛換引起的,其中G→A(867位)的轉換使137位的氨基酸由Ala(A)變?yōu)門hr(T),1377核苷酸位置處的C→G顛換導致307位的氨基酸由Arg(R)→Gly(G).5

4、'非編碼區(qū)的1個SNP是由第191核苷酸位置處的C→A顛換引起的.接下來,該研究進一步對單核苷酸多態(tài)性與雞的膚色、肉色、脛色等黑色素性狀進行了卡方獨立性分析,結果表明,MClR基因5'非編碼區(qū)191處的突變與雞的膚色性狀與肉色性狀極顯著相關(P<0.01),MClR基因867核苷酸位置處的G→A轉換與雞的膚色性狀顯著相關(P<0.05),第1377核苷酸位置處的C→G顛換與雞的肉色性狀顯著相關(P<0.05),第1292核苷酸位置處的C

5、→T轉換與雞的活體脛色性狀顯著相關(P<0.05).但這幾處單堿基突變與其它黑色素性狀相關不顯著(P>0.05).最后,該研究利用雞Chick RH6放射雜交板,對MClR基因進行了染色體上的精細定位,結果是把MClR基因定位在雞第11號染色體末端,位于標記ROS0112(X035)與ADL0033之間的位置.這是迄今為止雞MClR基因在染色體上的最為精確的定位結果.該研究結果表明,雞MClR基因的突變與雞的膚色、肉色、活體脛色這幾處雞