棉花纖維發(fā)育轉錄圖譜的構建.pdf

1、分類 號 密 級華 中農(nóng)業(yè) 大 學碩 士 學位 論文棉花纖維發(fā)育轉錄 圖譜 的構建C o n str u ctio no fTr a n sc r iP to m eM a Pfo rF ib e rD e v elo P m e n tinIn te r sP e e ificP o P u la tio no fC o tto n碩士研 究生 : 劉傳祥指 導 教師 : 張獻龍 教授指 導 小組 : 張獻龍 教授聶 以春 教授郭小平

2、 教授林 忠旭 副教授專業(yè) : 作物遺傳育種申請 學位 : 農(nóng)學碩士研 究方 向: 棉花遺傳育種獲 得 學位 時 間 : 2010 年 6 月 20 日華 中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學 院二 O 一 O 年 六 月一 一 竺 竺 些 魚 些 燮 些 些 全 絲 些 二 一 一2 . 1. 3 差 異 片段 的回收 、克 隆 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

3、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……H2.1. 4 差 異 序 列測 序 和 功 能預 測 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . ……132. 2 功 能標 記 的開 發(fā) 與 定位 . . . . . . . . .

4、 . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……132 . 2 .1 功 能標 記 的開發(fā) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

5、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……132， 2. 2 功 能標 記 的定位 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……132. 3 纖 維 發(fā)

6、育 轉錄 圖譜構 建 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……142 . 3.1 作 圖群 體 準 備 ， …， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

7、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……142. 3. 2 群 體 的 E ST-SSR 分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

8、. . . . . . . . ……142. 3. 3 轉 錄 圖譜 的構 建 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……141R N A 的質 量 . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

9、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……162 海 島棉 、 陸地 棉 纖維 發(fā) 育 的差 異 顯 示 . . ……， . . . . . . . . . . . . .

10、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……162 .1cD N A 一 SR A P 差 異 顯 示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

11、. . . . . …… 162 . 2 差 異 條 帶 的收集 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……172 . 3 差 異 序 列 的功 能預 測 . .

12、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……183 功 能標 記 的開 發(fā)和 定位 …， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

13、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……194 纖 維 發(fā) 育 轉 錄 圖譜 的構 建 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

14、. ……， . . . . . . . . . . . ……194 .1E ST-S SR 引物 分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . …… 194 .1.1 引物 來 源 . . .

15、. . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . …… 194.1. 2 引物 多態(tài) 性 分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

16、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . ……214 .1. 3 擴 增 產(chǎn) 物 的分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

17、 . . . . . . . ……234.2 轉 錄 圖譜 的構 建 . . … …， . . … 二 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……244 . 2.1 轉 錄 圖譜 的基 本 特 征 . . . . .

18、. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……244.2. 2 序 列 的功 能分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

19、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……295 從 標 記 的共 顯 性 探 討 海 陸 表 達 差 異 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . …… 296 各 個 發(fā) 育 時期 纖 維 的

20、E ST-SS R 分 析 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……301 海 島棉 、 陸地 棉 纖 維 發(fā) 育 的差 異 顯 示 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

21、 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……312 棉 花 纖 維 轉 錄 圖譜 的構 建 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……， . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……犯2.1 棉 纖 維 轉錄 圖

22、構 建 的必 要 性 和 展 望 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ……322. 2 關 于 本 實驗 作 圖方 法 的選 擇 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .