紫菜核糖體rDNA基因結構多樣性分析.pdf

1、紫菜是我國重要的海洋經(jīng)濟作物,是潮間帶藻類的模式物種。生活史包括大型配子體(葉狀體)世代和微型孢子體(絲狀體)世代,繁殖方式包括無性繁殖和有性繁殖兩種,這種特殊而又復雜的生活史使得紫菜在進化過程中具有較高的變異度。
　　核糖體rDNA基因作為一種分子標記用于研究種的分類及遺傳多樣性被廣泛接受,但最近研究發(fā)現(xiàn)許多真核生物的rDNA基因結構在種間及種內存在變異,甚至在個體內部ITS序列也存在多樣性。這種變異及多態(tài)性對于正確解釋物種的系

2、統(tǒng)發(fā)生和遺傳結構顯得尤為重要。本研究以條斑紫菜和壇紫菜為研究對象,對兩個物種野生群體和養(yǎng)殖群體的核糖體rDNA在基因結構的多樣性進行了分析,取得以下結果:
　　1.條斑紫菜養(yǎng)殖群體30個個體和野生群體27株個體的18SrDNA均不包含內含子序列,ITS序列未呈現(xiàn)明顯的插入/缺失,EcoRV帶型沒有呈現(xiàn)多樣性,表明所選用的來自不同品系的個體間及個體內18SrDNA-ITS-5.8SrDNA基因結構單一。其二級結構能使18SrRNA的

3、3'端、5.8SrRNA、28SrRNA5'端,三部分成熟端互相靠近,形成一個核心結構。
　　2.壇紫菜野生群體18SrDNA-ITS-5.8SrDNA在不同個體間及個體內呈現(xiàn)多態(tài)性,EcoRV帶型亦呈現(xiàn)多態(tài),測序分析發(fā)現(xiàn),部分個體18SrDNA含有I型內含子結構,大小為554bp,插入位點為18SrDNA的1803–1807位,GC含量為51.1％,不同個體內含子片段長度接近,但序列存在差異。表明18SrDNA協(xié)同進化存在差異。

4、而絲狀體不同品系間18SrDNA基因結構多樣性較低,10個品系的18SrDNA均含有內含子結構,一個品系內含子丟失。不同品系的ITS1區(qū)域和ITS2區(qū)域序列變異程度差別較大,構建的系統(tǒng)發(fā)生樹呈現(xiàn)不同的拓撲結構。純合絲狀體個體內部ITS序列不同拷貝序列相似度為100%,表明協(xié)同進化程度較高。條斑紫菜ITS序列未呈現(xiàn)長度多態(tài)性,堿基序列存在不同程度變異。
　　本研究結果將為紫菜的種質鑒定及遺傳多樣性分析提供理論支持,也將為了解紫菜屬物