對(duì)基因間相互作用的研究和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè).pdf

1、該文中我們先應(yīng)用改進(jìn)后的微分方程模型對(duì)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了推測(cè).以往的微分方程模型由于方程中的參數(shù)個(gè)數(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于實(shí)際的時(shí)間點(diǎn)的個(gè)數(shù)的緣故,沒能將微分方程應(yīng)用于基因組水平的真實(shí)測(cè)量數(shù)據(jù);而這種改進(jìn)后的微分方程不是通過直接確定參數(shù)值,而是將多元回歸分析應(yīng)用于方程,從而由真實(shí)的芯片試驗(yàn)數(shù)據(jù)推測(cè)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò).在實(shí)施微分方程算法推測(cè)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的過程中,我們發(fā)現(xiàn)這一模型對(duì)結(jié)果的表達(dá)不太令人滿意,因而該文又研究了平滑響應(yīng)表面(SRS)算法.SRS算法可

2、用來分析基因表達(dá)數(shù)據(jù),在基因組水平上描述促進(jìn)子、抑制子和目標(biāo)基因三聯(lián)體.文中我們應(yīng)用SRS算法處理芽孢酵母S.cerivisiae細(xì)胞周期過程中檢測(cè)到的基因表達(dá)數(shù)據(jù),并結(jié)合生物學(xué)實(shí)際校驗(yàn)推測(cè)了由某些可能對(duì)細(xì)胞周期具有非凡意義的基因所構(gòu)成的局部基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖.此外,根據(jù)計(jì)算結(jié)果,有一些基因的生物活性現(xiàn)在還沒有實(shí)驗(yàn)觀測(cè)數(shù)據(jù)來明確鑒定,但它們的分值提示它們有可能值得特別的關(guān)注.此外,我們對(duì)原始SRS算法作了一定改進(jìn),并將改進(jìn)后的算法應(yīng)用到對(duì)基