基于多肽結構的HDAC小分子配體的合成.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、賴氨酸的酰基化修飾是蛋白表達后修飾的形式之一,由組蛋白去乙酰化酶(HDACs)與組蛋白乙?;D移酶(HATs)協(xié)同調控。本論文探討了含有AMC熒光團的HDAC多肽配體分子的新合成策略及其在化學生物學研究中的應用。
  含有熒光基團 AMC底物多肽化合物是酶學研究和化學生物學研究常用的探針分子。由于該類多肽化合物的C端被AMC占據(jù),因而,傳統(tǒng)的合成策略,其最終的組裝步驟通常需要在液相中完成。我們建立了一個新策略以合成Ac-P-2-P

2、-1-Lys(Ac)-AMC多肽:在 Lys(Ac)片段的乙?;撂荚由吓R時引入巰基,從而能直接地通過固相合成得到目標多肽化合物。在構建相關組合肽庫時,該新方法的高效性優(yōu)勢尤為突出。
  自然界中,Lys側鏈的?;揎椈鶊F除常見的乙?;?,還包括丙?;⒍□;鹊拓S度修飾方式。根據(jù)文獻中的結構生物學結果,我們猜想:HDAC酶活中心的GGXHH模體(motif)中,X殘基的側鏈的大小可能是影響HDAC的?;x擇性的決定性因素之一。

3、我們合成了四個含有 AMC熒光底物多肽,分別含有乙酰,丙酰,異丁酰和丁酰修飾的 Lys;另一方面,通過定點突變,表達了四個突變的HDAC8蛋白,分別將野生型中位于X位置的Trp殘基突變?yōu)檩^小的Phe,His,Ala和Gly殘基。我們發(fā)現(xiàn):野生型HDAC8對丁酰化底物的活性極弱,對乙?;孜锘钚院軓姡荘he和His突變蛋白的情形正好相反。該實驗初步驗證了我們的假設。同時,由于突變GGXHH模體中的X殘基而得到的突變 HDAC蛋白可以改

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