雀形目15種鳥類CoI和Cyt b基因序列比較及伯勞屬的系統(tǒng)發(fā)育.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、雀形目(Passeriformes)是現(xiàn)存鳥類中種類最多、數(shù)量最大的、演化地位最高、適應輻射最廣的類群,傳統(tǒng)的分類方法僅依據(jù)形態(tài)和行為特征來劃分,但由于該類群的形態(tài)及行為特征復雜使得部分種類不易區(qū)分,因此有必要依據(jù)分子手段研究其系統(tǒng)發(fā)生關系、以盼能對經(jīng)典的分類方法給予補充。本文分別以線粒體DNA的細胞色素6和CoI基因作為分子標記,對雀形目6科15種鳥類的細胞色素6基因全序列(1,143bp)和CoI基因部分序列(1,176bp)的組成

2、特點及其系統(tǒng)發(fā)育樹進行了比較分析,還探討了CoI基因作為雀形目系統(tǒng)發(fā)育研究和構建鳥類物種DNA編碼庫的分子標記的可行性,旨在為DNA編碼庫的構建積累基礎資料。此外,針對伯勞屬(Lanius)鳥類在形態(tài)分類上目前存在的一些爭論,還分析了該屬8種鳥類的細胞色素6全序列和Col基因部分序列,并以鶇亞科(Muscicapinae)的棕胸藍[姬]鶇(Ficedula hyperythra)和河烏科(Cinclidae)的褐河烏(Cincluspa

3、llasii)作為外群,分別構建了單基因數(shù)據(jù)和聯(lián)合基因數(shù)據(jù)的MP樹、ML樹、NJ樹和Bayesian樹,在此基礎上初步分析了它們之間的系統(tǒng)發(fā)生關系,并探討了伯勞屬部分類群的分類地位。 1.比較分析了雀形目6科15種鳥類的細胞色素6全序列和CoI基因部分序列,結果顯示細胞色素6和CoI基因序列的變異位點分別為454個和366個、簡約信息位點為337個和303個,而且線粒體CoI基因比細胞色素b基因略微保守、進化速率也較低;CoI基

4、因在確定雀形目科級階元之間的系統(tǒng)發(fā)生關系方面是一種有效的分子標記,同時它也能夠用于雀形目鳥類的物種鑒定,但在物種鑒別方面不如細胞色素6基因穩(wěn)定、準確。本文建議若以CoI基因作為標記進行鳥類的物種鑒別,最好再輔以其它的分子標記。 2.對伯勞屬鳥類的系統(tǒng)發(fā)生關系分析后表明,黑額伯勞(L.minor)和虎紋伯勞(L.tigrinus)首先分化出,接著分化出平行的兩個支系:一支由互為姐妹群的荒漠伯勞(L.isabellinus)和紅背伯

5、勞(L.collurio)組成,另一支由灰背伯勞(L.tephronotus)、牛頭伯勞(L.bucephalus)聚在一起后與紅尾伯勞(L.cristatus)并列再與棕背伯勞(L.schach)相聚而形成。由此可見,牛頭伯勞和灰背伯勞是最晚分化出的類群。 3.本文分析比較了兩種分子標記及其聯(lián)合數(shù)據(jù)集所構建的伯勞屬部分鳥類的系統(tǒng)發(fā)生樹和這些鳥類類群的形態(tài)特征、地理分布特點后表明,伯勞屬的荒漠伯勞、紅背伯勞均為獨立的物種;本文還

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