模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌全基因表達影響研究.pdf

1、目的：
　　本課題通過觀察牙周致病菌牙齦卟啉單胞菌ATCC33277在模擬微重力環(huán)境下細菌生長和全基因表達，研究相關(guān)差異基因在牙齦卟啉單胞菌模擬微重力環(huán)境中參與應(yīng)答、代謝過程的變化，旨在揭示模擬微重力環(huán)境對牙齦卟啉單胞菌增殖、全基因表達的影響，為指導(dǎo)和維護航天員的口腔健康提供實驗依據(jù)。
　　材料和方法：
　　本研究使用美國NASA研發(fā)的旋轉(zhuǎn)細胞培養(yǎng)系統(tǒng)RCCS-4地面模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境,以牙齦卟啉單胞菌ATCC33

2、277為研究對象，設(shè)為實驗組（模擬微重力）和對照組，分別培養(yǎng)、記錄生長曲線，利用高通量轉(zhuǎn)錄組測序的方法根據(jù)有生物學(xué)重復(fù)實驗標準設(shè)定padj＜0.05為閾值篩選差異表達的基因，分析差異基因聚類和GO、KEGG富集功能集團。
　　結(jié)果：
　　1.模擬系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境下牙齦卟啉單胞菌生長曲線，靜止期和平臺期實驗組和對照組變化無統(tǒng)計學(xué)意義（P＞0.05），對數(shù)生長期兩組差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P＜0.05），實驗組較對照組細菌增殖加快。

3、
　　2.轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)，實驗組71個基因差異表達，12個上調(diào)的基因包括參與編碼血細胞凝集素HagA的基因，編碼結(jié)合轉(zhuǎn)座子TraG的基因等。59個下調(diào)的基因有包括編碼細菌鞭毛fimA、fimC、fimD、fimE、mfal的基因等。
　　3.通過對差異基因的富集和GO、KEEG聚類分析發(fā)現(xiàn)在模擬微重力環(huán)境下，牙齦卟啉單胞菌通過調(diào)整DNA復(fù)制、氧化物/超氧化物代謝活性、宿主間和細胞間的信號傳播和運動、ATP酶跨膜轉(zhuǎn)運活動。