基于猬蝦線粒體基因組的十足目高級階元系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、進入二十一世紀(jì)以來，利用線粒體基因組研究十足目動物的高階系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系得到了很多學(xué)者的重視。到目前為止，已經(jīng)有30多個十足目物種的線粒體基因組被測定，但是所得到的基因組數(shù)據(jù)在十足目內(nèi)部個分類單元的分布極不均衡。
　　十足目是一類物種極其多樣的甲殼動物，作為系統(tǒng)發(fā)育研究的重要類群，眾多學(xué)者對十足目的形態(tài)學(xué)與分子生物學(xué)方面做了大量研究。十足目本身作為一個單系群已為大多數(shù)學(xué)者認(rèn)可，但是對于十足目內(nèi)部的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系還沒有達成一致的認(rèn)識。

2、r>　　迄今為止，還沒有猬蝦下目的線粒體基因組全序列數(shù)據(jù)，本文第一次報道了來自猬蝦下目的Stenopus hispidus(Olivier1811).的線粒體基因組全序列。Stenopushispidus線粒體基因全長為15，528 bp，包含13個蛋白質(zhì)編碼基因、2個核糖體RNA基因和一個非編碼的AT富含區(qū)；與后生動物典型的線粒體基因組22個轉(zhuǎn)運RNA基因相比，存在1個trnQ基因的重復(fù)，一共含有23個轉(zhuǎn)運RNA基因。和泛甲殼動物的線

3、粒體基因組原始排列相比，Stenopus hispidus線粒體基因組全序列的基因排列出現(xiàn)了5個轉(zhuǎn)運RNA基因的易位(trnL1，trnE，trnR，trnM，trnQ)，1個轉(zhuǎn)運RNA基因的倒置(trnL1)，還有1個轉(zhuǎn)運RNA基因的重復(fù)(trnQ)。可以看出，在猬蝦下目中線粒體基因的基因序列排列并不保守。
　　基于線粒體基因組的13個蛋白質(zhì)編碼基因的核苷酸和氨基酸序列的系統(tǒng)發(fā)育分析支持十足目(Decapoda)、枝鰓亞目(De

4、ndrobranchiata)、腹胚亞目(Pleocyemata)、和爬行亞目(Reptantia)的單系性。本研究也支持真蝦下目(Caridea)、猬蝦下目(Stenopodidea)、異尾下目(Anomura)、短尾下目(Anomura)、龍蝦下目(Palinura)和鰲蝦下目(Astacidea)的單系性。研究結(jié)果表明真蝦下目(Caridea)位于腹胚亞目(Pleocyemata)基部位置，猬蝦下目(Stenopodidea)和爬